11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2013 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1223    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1149  hypothetical protein  34.39 
 
 		 567 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.658364  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0523  hypothetical protein  25.85 
 
 		 582 aa  206  8e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0935  hypothetical protein  26.35 
 
 		 583 aa  196  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0337995  normal  0.523565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0678  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6855  hypothetical protein  23.49 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.13 
 
 		 265 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0994  hypothetical protein  21.12 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  23.78 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>