97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0678 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0678  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 476 aa  939    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  26.29 
 
 		 611 aa  94.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  22.98 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.69 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 		 390 aa  67  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  22.88 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  23.98 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.18 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  21.78 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2013  hypothetical protein  27.22 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2768  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.79 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 		 382 aa  57  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  21.14 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  23.91 
 
 		 627 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.7 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 		 374 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  20.53 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  19.19 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  22.71 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  21.78 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  20.19 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  20.69 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.4 
 
 		 385 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  19.89 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0523  hypothetical protein  23.66 
 
 		 582 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  21.6 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.81 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  21.89 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0935  hypothetical protein  20.12 
 
 		 583 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0337995  normal  0.523565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 390 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 403 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.31 
 
 		 289 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1149  hypothetical protein  25.96 
 
 		 567 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.658364  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 376 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  36.11 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 386 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  21.43 
 
 		 378 aa  47.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.57 
 
 		 677 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.49 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  17.65 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  20.87 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.86 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  19.42 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  24.29 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  27.78 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  23.13 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  23.13 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  25.23 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 370 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.92 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 381 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  27.93 
 
 		 277 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4059  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 		 370 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 392 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  34.67 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.25 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.25 
 
 		 369 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.02 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.25 
 
 		 369 aa  43.5  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.02 
 
 		 371 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>