204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3160 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 289 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  80.87 
 
 		 277 aa  481  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  73.05 
 
 		 293 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  73.67 
 
 		 293 aa  441  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  36.36 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  40.69 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.71 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  38.04 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  36.18 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  35.18 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  34.55 
 
 		 337 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  35.1 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.78 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  35.34 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  38.04 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.34 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  34.54 
 
 		 339 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  40.99 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  36.51 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  36.65 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.21 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  36.65 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  36.32 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  37.33 
 
 		 252 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  33.73 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  31.84 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.27 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  36.2 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  36.2 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.27 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  37.05 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  35.68 
 
 		 338 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  35.68 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.74 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  35.75 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  34.58 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  34.58 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.47 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.47 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.47 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  32.16 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.84 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  38.25 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  38.74 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37.79 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  35.32 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  35.04 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  35.44 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  35.59 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  34.13 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  34.36 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  34.36 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.24 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  35.17 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  35.17 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  35.56 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.15 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  33.71 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.15 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.15 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.15 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  36.19 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  34.6 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.6 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  34.6 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.6 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  33.76 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.73 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  34.53 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.36 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  34.08 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  34.32 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  33.46 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>