203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3128 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  63.28 
 
 		 257 aa  349  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  62.2 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  60.96 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  58.53 
 
 		 289 aa  332  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  61.42 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  58.37 
 
 		 258 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  58.11 
 
 		 285 aa  331  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  62.81 
 
 		 281 aa  325  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  59.47 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  57.78 
 
 		 265 aa  311  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  58.47 
 
 		 268 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  56.13 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  59.11 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  59.11 
 
 		 265 aa  295  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  52.12 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  53.78 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  56.63 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  54.44 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 280 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  53.39 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  53.39 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  53.39 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  57.2 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  51.69 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  54.03 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  53.63 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  53.63 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  54.51 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  56.49 
 
 		 265 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  52.12 
 
 		 295 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  54.72 
 
 		 263 aa  284  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  53.69 
 
 		 286 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  52.61 
 
 		 295 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  53.91 
 
 		 284 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  47.7 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  50.87 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.64 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  47.06 
 
 		 339 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  47.06 
 
 		 339 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  43.13 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  46.64 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  47.39 
 
 		 341 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  46.99 
 
 		 341 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  45.8 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  44.14 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  46.12 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  40.98 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  45.26 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  44.68 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  40 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  44.35 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  40.34 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  41.04 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  40.57 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  39.2 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  39.58 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.08 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  41.33 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  41.78 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  43.91 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  41.78 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  38.52 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  41.33 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  41.33 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  38.52 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  46.4 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  40.89 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  40.93 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  39.11 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.11 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  39.11 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  39.11 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  36.1 
 
 		 257 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  39.41 
 
 		 243 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  39.92 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.92 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  39.74 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  39.74 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  39.74 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  39.74 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  39.74 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  43.2 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.89 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.89 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.89 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  38.99 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  38.99 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.14 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.14 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.14 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.14 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  38.14 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>