48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0542 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0542  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  100 
 
 		 611 aa  1259    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  47.95 
 
 		 610 aa  585  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0678  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 476 aa  94.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  20.85 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  22.3 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 373 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  22.78 
 
 		 369 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  21.33 
 
 		 371 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 373 aa  50.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  20.95 
 
 		 370 aa  50.8  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  20.77 
 
 		 384 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.09 
 
 		 404 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 370 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  22.98 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.98 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0104  Extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 370 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2768  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  27.05 
 
 		 417 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  20.66 
 
 		 378 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  21.38 
 
 		 376 aa  47.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  21.26 
 
 		 381 aa  47.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  20.28 
 
 		 371 aa  47.4  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0098  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 411 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  18.95 
 
 		 376 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 411 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  25 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 		 370 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.14 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 402 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  22.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 385 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 376 aa  43.9  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 373 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>