106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2150 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 501 aa  1036    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  23.43 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  33.09 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  32.17 
 
 		 634 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  33.56 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  37.82 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  22.22 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  33.08 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0994  hypothetical protein  21.54 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  30.28 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  34.19 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  29.23 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 307 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  29.27 
 
 		 583 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  31.36 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  28.03 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.37 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  23.78 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.21 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 650 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  25.93 
 
 		 349 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.9 
 
 		 637 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  34.74 
 
 		 426 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  25.95 
 
 		 849 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.09 
 
 		 335 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  38.1 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  25.85 
 
 		 283 aa  53.5  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.03 
 
 		 631 aa  53.5  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  29.36 
 
 		 173 aa  53.5  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  27.88 
 
 		 393 aa  53.5  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  28.95 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.03 
 
 		 593 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  23.55 
 
 		 304 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6487  Peptidoglycan-binding LysM  34.31 
 
 		 341 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.577671  normal  0.707539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  26.61 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  24.11 
 
 		 179 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  27.21 
 
 		 342 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  29.01 
 
 		 342 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  27.36 
 
 		 420 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.04 
 
 		 470 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  26.37 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.09 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.690054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  28.42 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6855  hypothetical protein  23.39 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  27.35 
 
 		 341 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  27.19 
 
 		 544 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  30.19 
 
 		 112 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  34.04 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  31.2 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  25.58 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  36.62 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  27.13 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 503 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  30.43 
 
 		 466 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  29.63 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.78 
 
 		 620 aa  48.5  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0935  hypothetical protein  24.09 
 
 		 583 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0337995  normal  0.523565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  29.36 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0523  hypothetical protein  24.66 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.69 
 
 		 230 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  27.33 
 
 		 409 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  27.35 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  29.36 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.21 
 
 		 840 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 530 aa  47.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  25.85 
 
 		 338 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 555 aa  47  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  24.84 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.25 
 
 		 576 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 		 142 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  32.54 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.54 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.7 
 
 		 1001 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  29.51 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  27.34 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  27.42 
 
 		 542 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  26.99 
 
 		 1021 aa  45.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 		 250 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  25.76 
 
 		 347 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  25.38 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  21.31 
 
 		 262 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  21.64 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.38 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  27.34 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  28.85 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  30.11 
 
 		 546 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 587 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  28.42 
 
 		 267 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.86 
 
 		 679 aa  44.3  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  30.12 
 
 		 208 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 390 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 570 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  28.1 
 
 		 557 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  31.3 
 
 		 498 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 253 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  26.5 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>