79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2121 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  30.08 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  27.87 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  32.76 
 
 
698 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 
142 aa  55.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.38 
 
 
338 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  33.96 
 
 
467 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.03 
 
 
470 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  28.23 
 
 
330 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 
409 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 
304 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 
612 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  31.71 
 
 
514 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.03 
 
 
612 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  31.09 
 
 
389 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  48.94 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  25.58 
 
 
173 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  25.81 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
544 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 
503 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  31.97 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  28.44 
 
 
527 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  48.94 
 
 
426 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.23 
 
 
620 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  35.04 
 
 
444 aa  49.3  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  31.78 
 
 
557 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  26.4 
 
 
420 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.87 
 
 
1001 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  48.94 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  27.1 
 
 
466 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  29.91 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  25.2 
 
 
123 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.81 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  31.71 
 
 
642 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 
650 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  28.26 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1214  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 
1130 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.92 
 
 
384 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30 
 
 
341 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  27.4 
 
 
499 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  30.33 
 
 
403 aa  45.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  27.87 
 
 
403 aa  45.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  24.63 
 
 
423 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  44.68 
 
 
305 aa  45.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  22.95 
 
 
412 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
405 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  29.36 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  47.92 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  28.23 
 
 
542 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  31.71 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  34.31 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  34.31 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.81 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09389  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 
589 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  0.0327023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  24.39 
 
 
539 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  30 
 
 
695 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 
548 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  27.7 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.84 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 
191 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  28.8 
 
 
523 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.11 
 
 
528 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  28.46 
 
 
442 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.87 
 
 
552 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  29.05 
 
 
443 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 
207 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  24.22 
 
 
556 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.22 
 
 
377 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  27.64 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  28.3 
 
 
290 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  29.91 
 
 
253 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  27.87 
 
 
546 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  25.4 
 
 
301 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  25.4 
 
 
1079 aa  42  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  29.6 
 
 
284 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  26.45 
 
 
517 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  26.32 
 
 
501 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>