217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2994 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  100 
 
 		 467 aa  953    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  38.93 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  34.23 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5051  Peptidoglycan-binding LysM  28.88 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  32.06 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  44.68 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3043  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.19 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  31.46 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  36.6 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  31.48 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  33.94 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.67 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  37.63 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  37.14 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  33.91 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.26 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.02 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 849 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  31.85 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  35.42 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  33.93 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.61 
 
 		 1001 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  30.58 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  34.51 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.45 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  32.98 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  25.33 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.98 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  31.48 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.64 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  27.73 
 
 		 651 aa  57  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  30.25 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  30.36 
 
 		 142 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  31.48 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.84 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.93 
 
 		 840 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  24.46 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  31.58 
 
 		 265 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25 
 
 		 509 aa  54.3  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  27.03 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  31.21 
 
 		 290 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  27.15 
 
 		 310 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  33.33 
 
 		 303 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  28.69 
 
 		 445 aa  53.5  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.2 
 
 		 277 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  27.2 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  30.84 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 		 618 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.74 
 
 		 754 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  25.67 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  31.58 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.15 
 
 		 295 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  31.48 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  31.13 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  30.09 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.41 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.41 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  26.23 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 		 637 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.35 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.99 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.41 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.57 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.03 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  33.68 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.41 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6487  Peptidoglycan-binding LysM  27.49 
 
 		 341 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.577671  normal  0.707539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 		 631 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  31.13 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  26.89 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  28.65 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 		 522 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  31.13 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 112 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  30.08 
 
 		 286 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  29.58 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.08 
 
 		 530 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  29.32 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  25.18 
 
 		 550 aa  50.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  28.26 
 
 		 346 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.91 
 
 		 593 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 		 265 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  26.4 
 
 		 620 aa  50.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  28.85 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  28.85 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  26 
 
 		 175 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  31.25 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2121  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.96 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  28.93 
 
 		 1021 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>