More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3908 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 544 aa  1100    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  60.37 
 
 		 572 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  60.45 
 
 		 573 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  60.45 
 
 		 573 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  42.75 
 
 		 506 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  43.57 
 
 		 487 aa  279  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41.13 
 
 		 617 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  42.59 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 507 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 498 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  40.49 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 448 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  36.79 
 
 		 638 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 733 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  30.07 
 
 		 620 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  35.45 
 
 		 618 aa  216  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  34.19 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  34.13 
 
 		 587 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 		 693 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.85 
 
 		 554 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  35.36 
 
 		 580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  33.25 
 
 		 595 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  34.35 
 
 		 548 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.48 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  34.99 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.79 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 		 498 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  29.55 
 
 		 495 aa  190  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.31 
 
 		 515 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.56 
 
 		 534 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  29.19 
 
 		 403 aa  186  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.54 
 
 		 527 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 556 aa  182  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.24 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  27.98 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.5 
 
 		 532 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  33.68 
 
 		 534 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  30 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  31.52 
 
 		 518 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 415 aa  180  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  34.77 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.88 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  29 
 
 		 596 aa  176  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  28.13 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  28.95 
 
 		 661 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  32.72 
 
 		 479 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.62 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  28.88 
 
 		 539 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  32.2 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  29.95 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  31.74 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  32.55 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  32.74 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  31.78 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  32.32 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  32.75 
 
 		 476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.82 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  32.49 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  32.99 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 517 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.9 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  32.26 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.63 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  30.71 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  31.13 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  31.13 
 
 		 515 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  30.72 
 
 		 379 aa  160  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.85 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  34.28 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  31.13 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 498 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.91 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.75 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.75 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.98 
 
 		 464 aa  159  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.92 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  34.81 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  31.87 
 
 		 495 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.07 
 
 		 465 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.72 
 
 		 475 aa  156  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  29.23 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  30.68 
 
 		 578 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.17 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.85 
 
 		 515 aa  154  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 		 440 aa  154  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.66 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.66 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.66 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  29.77 
 
 		 522 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  31.66 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.75 
 
 		 406 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.66 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.75 
 
 		 406 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 419 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 281 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  32.73 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>