More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1010 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  100 
 
 		 506 aa  1031    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  75.26 
 
 		 499 aa  758    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  63.55 
 
 		 507 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  69.76 
 
 		 487 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  68.29 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  62.56 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  54.23 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  46.88 
 
 		 617 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  42.03 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 		 638 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 733 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  40.5 
 
 		 572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 573 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  35.9 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  39.9 
 
 		 573 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 693 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 620 aa  233  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  35.7 
 
 		 544 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 547 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  35.12 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  35.13 
 
 		 580 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.19 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 		 618 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  33.87 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  34.58 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  34.24 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.82 
 
 		 543 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.09 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.14 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  32.93 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  34.21 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  32.18 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  32.85 
 
 		 515 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  35.08 
 
 		 404 aa  192  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  33.42 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  32.61 
 
 		 515 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  32.31 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  33.6 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.13 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  33.69 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  31.42 
 
 		 495 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.85 
 
 		 498 aa  186  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  29.96 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  31.81 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  34.6 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.16 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  29.31 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  29.3 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.93 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  29.9 
 
 		 518 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  35.44 
 
 		 534 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  34.13 
 
 		 524 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  30.58 
 
 		 485 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  37.6 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.04 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.87 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.1 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.7 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  32.1 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.93 
 
 		 534 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  31.51 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.01 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 415 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  31.34 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  31.51 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  33.68 
 
 		 473 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  34.38 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  34.38 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  33.6 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  30.95 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 492 aa  170  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  32.05 
 
 		 529 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.08 
 
 		 464 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.17 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  32.13 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.64 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.64 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.65 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.65 
 
 		 459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  28.01 
 
 		 596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 		 529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.52 
 
 		 527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.39 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.65 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  28.35 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  28.11 
 
 		 523 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  31.5 
 
 		 561 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.1 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  31.46 
 
 		 525 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>