More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3789 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  58.89 
 
 		 544 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  100 
 
 		 572 aa  1142    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  91.8 
 
 		 573 aa  969    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  91.45 
 
 		 573 aa  971    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.81 
 
 		 617 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  40.75 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  43.53 
 
 		 487 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  42.29 
 
 		 484 aa  250  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  38.75 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  37.36 
 
 		 498 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.98 
 
 		 620 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.18 
 
 		 733 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 448 aa  223  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 		 638 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.96 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 		 693 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  33.41 
 
 		 547 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  32.19 
 
 		 587 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 		 595 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  32.86 
 
 		 553 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  31.12 
 
 		 404 aa  188  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.76 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.42 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  32.09 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  32.6 
 
 		 580 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.64 
 
 		 515 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  28.92 
 
 		 495 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 		 474 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  29.85 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.77 
 
 		 532 aa  177  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.76 
 
 		 530 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  29.34 
 
 		 403 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  29.33 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.35 
 
 		 527 aa  174  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 518 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  29.85 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  31.76 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.5 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.26 
 
 		 543 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 539 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  31.32 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  30.5 
 
 		 515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  30.77 
 
 		 515 aa  164  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  31.4 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  32.68 
 
 		 479 aa  163  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  30.41 
 
 		 492 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  31.11 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  27.96 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.24 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  30.41 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.02 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  30.75 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  29.53 
 
 		 485 aa  160  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.5 
 
 		 515 aa  159  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  30.41 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  31.83 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.48 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  28.03 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 		 517 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.17 
 
 		 372 aa  158  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.64 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  28.46 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  29.73 
 
 		 524 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  30.86 
 
 		 372 aa  156  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  31.69 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  30.48 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  33.42 
 
 		 550 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  31.3 
 
 		 515 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.99 
 
 		 596 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.03 
 
 		 515 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  28.46 
 
 		 511 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.03 
 
 		 519 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.03 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 514 aa  153  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  29.31 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  31.44 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 		 379 aa  150  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  33.21 
 
 		 383 aa  150  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.83 
 
 		 499 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  27.09 
 
 		 661 aa  150  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  28.15 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  28.34 
 
 		 556 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.06 
 
 		 457 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.5 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.5 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.8 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.13 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.5 
 
 		 395 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  26.93 
 
 		 539 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  34.01 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  28.53 
 
 		 474 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>