More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3846 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
573 aa  1142    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  94.42 
 
 
572 aa  993    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  60.41 
 
 
544 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  98.95 
 
 
573 aa  1130    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.28 
 
 
617 aa  287  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  39.08 
 
 
507 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  40.9 
 
 
506 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  38.52 
 
 
499 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  42.93 
 
 
487 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  37.53 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  42.68 
 
 
484 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  39.15 
 
 
499 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 
620 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  35.12 
 
 
733 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 
448 aa  226  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  34.76 
 
 
638 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  35.52 
 
 
693 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.26 
 
 
544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 
547 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.66 
 
 
595 aa  200  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  33.48 
 
 
587 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  32.4 
 
 
618 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 
553 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.07 
 
 
498 aa  193  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 
548 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.94 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.03 
 
 
534 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  33.06 
 
 
580 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  33.08 
 
 
556 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  31.03 
 
 
404 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.97 
 
 
552 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.77 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.38 
 
 
518 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.98 
 
 
532 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.41 
 
 
530 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  31.94 
 
 
534 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  30.32 
 
 
415 aa  179  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.46 
 
 
527 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  29.51 
 
 
403 aa  177  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  29.67 
 
 
495 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  29.3 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  30.03 
 
 
403 aa  174  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.18 
 
 
543 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.14 
 
 
528 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  29.74 
 
 
474 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  31.79 
 
 
476 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  33.43 
 
 
479 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  34.15 
 
 
539 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  30.96 
 
 
473 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 
492 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  33.15 
 
 
479 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  30.8 
 
 
476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  30.8 
 
 
476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  32.2 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  31.5 
 
 
515 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.2 
 
 
519 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  29.76 
 
 
518 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  30.69 
 
 
515 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.37 
 
 
372 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.22 
 
 
515 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  30.69 
 
 
515 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.06 
 
 
372 aa  161  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  29.15 
 
 
523 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.69 
 
 
514 aa  160  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  32.79 
 
 
550 aa  160  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  27.86 
 
 
546 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  30.75 
 
 
372 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  30.22 
 
 
485 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  30.43 
 
 
495 aa  158  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  31.7 
 
 
514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  31.75 
 
 
515 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.75 
 
 
519 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.75 
 
 
515 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.75 
 
 
515 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  30.4 
 
 
519 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  33.25 
 
 
446 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  29.16 
 
 
511 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.33 
 
 
517 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  29.31 
 
 
555 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  27.86 
 
 
539 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 
524 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  35.02 
 
 
458 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  34.33 
 
 
383 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 
379 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  30.69 
 
 
516 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  30.79 
 
 
516 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  31.44 
 
 
442 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  30.48 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.21 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 
578 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.25 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.99 
 
 
457 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 
504 aa  148  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  29.58 
 
 
474 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  30.48 
 
 
557 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.55 
 
 
464 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  32.98 
 
 
445 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 
504 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  28.72 
 
 
474 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>