More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0661 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
415 aa  854    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  39.95 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  37.92 
 
 
403 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  36.96 
 
 
403 aa  296  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 
379 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.28 
 
 
372 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.28 
 
 
372 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40 
 
 
372 aa  277  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  36.7 
 
 
383 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 
733 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 
544 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  30.1 
 
 
620 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  31.22 
 
 
507 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 
547 aa  186  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 
587 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  31.81 
 
 
499 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.01 
 
 
554 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 
487 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 
447 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 
544 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.62 
 
 
617 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  30.13 
 
 
506 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.4 
 
 
518 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  31.99 
 
 
484 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 
499 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  31.89 
 
 
498 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.54 
 
 
442 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 
618 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0300  regulatory protein dnir  31.36 
 
 
321 aa  167  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.89505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  28.8 
 
 
572 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 
596 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32 
 
 
528 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.01 
 
 
534 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.56 
 
 
515 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  26.97 
 
 
448 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  32.95 
 
 
548 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.2 
 
 
552 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  29.24 
 
 
522 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.29 
 
 
457 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.84 
 
 
457 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
573 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 
573 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 
498 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
452 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
452 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
452 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  29.21 
 
 
452 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
406 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
452 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
452 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.21 
 
 
406 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
638 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  29.4 
 
 
504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 
553 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.79 
 
 
543 aa  156  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.66 
 
 
464 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 
467 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  27.91 
 
 
595 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  30.19 
 
 
473 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  30.14 
 
 
693 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  31.37 
 
 
534 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.61 
 
 
455 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  29.56 
 
 
515 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  28.89 
 
 
504 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.36 
 
 
406 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  29.18 
 
 
524 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.75 
 
 
532 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  29.38 
 
 
476 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.36 
 
 
406 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.36 
 
 
406 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  29.48 
 
 
445 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.47 
 
 
465 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.36 
 
 
406 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.53 
 
 
530 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  29.38 
 
 
476 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  27.39 
 
 
528 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  29.87 
 
 
578 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 
509 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  29.02 
 
 
501 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  30.03 
 
 
539 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.4 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  29.89 
 
 
446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.4 
 
 
459 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  31.77 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.16 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  27.58 
 
 
556 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.53 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  28.85 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  29.07 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  28.76 
 
 
476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  31.19 
 
 
440 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  26.38 
 
 
561 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  27.3 
 
 
524 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  26.63 
 
 
529 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  26.88 
 
 
531 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  26.63 
 
 
529 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  27.07 
 
 
523 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  26.38 
 
 
552 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  27.85 
 
 
555 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  28.28 
 
 
514 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>