More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0411 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
447 aa  907    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.97 
 
 
544 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 
620 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  33.25 
 
 
498 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 
587 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  31.22 
 
 
523 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  31.6 
 
 
547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  32.47 
 
 
506 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 
498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 
499 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  31.36 
 
 
484 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  31.85 
 
 
499 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 
507 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 
487 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  29.33 
 
 
495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  46.74 
 
 
618 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  31.3 
 
 
638 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 
415 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 
595 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  31.07 
 
 
555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  29.88 
 
 
440 aa  173  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.08 
 
 
617 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 
733 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 
322 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.96 
 
 
515 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.96 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.79 
 
 
530 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  28.5 
 
 
448 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  30.18 
 
 
610 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  32.66 
 
 
534 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  28.35 
 
 
596 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  29.44 
 
 
556 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  29.47 
 
 
661 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.94 
 
 
527 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  31.77 
 
 
442 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.99 
 
 
457 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.6 
 
 
543 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.48 
 
 
472 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.48 
 
 
457 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.48 
 
 
459 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.31 
 
 
395 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.14 
 
 
475 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  28.8 
 
 
518 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 
524 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  36.13 
 
 
562 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 
523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  32.28 
 
 
492 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  30.59 
 
 
446 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  29.95 
 
 
516 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.5 
 
 
552 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 
561 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  29.69 
 
 
516 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  28.37 
 
 
405 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.09 
 
 
1001 aa  150  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 
544 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  40.09 
 
 
1021 aa  150  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  27.91 
 
 
650 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.36 
 
 
372 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  29.97 
 
 
524 aa  150  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  30.14 
 
 
580 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  29.91 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  33.52 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.39 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  29.91 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  29.36 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  31.9 
 
 
476 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.57 
 
 
464 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 
570 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  30.62 
 
 
539 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  35.47 
 
 
281 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  30.26 
 
 
467 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.92 
 
 
465 aa  147  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  40.78 
 
 
451 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.66 
 
 
455 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  31.9 
 
 
476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  37.34 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.08 
 
 
406 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.08 
 
 
406 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  27.45 
 
 
527 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.08 
 
 
406 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.08 
 
 
406 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  28.76 
 
 
451 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  28.65 
 
 
476 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  28.41 
 
 
570 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  28.36 
 
 
383 aa  143  5e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  38.53 
 
 
1079 aa  144  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  25.84 
 
 
564 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  28.31 
 
 
557 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  28.98 
 
 
501 aa  143  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25 
 
 
564 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.54 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  26.25 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 
561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  25.32 
 
 
548 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  29.38 
 
 
522 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.75 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  29.92 
 
 
377 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  27.69 
 
 
553 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>