39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1966 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  100 
 
 
524 aa  1061    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  60.95 
 
 
518 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  54.95 
 
 
1194 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1968  hypothetical protein  50.18 
 
 
425 aa  269  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1961  hypothetical protein  37.45 
 
 
300 aa  170  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1962  hypothetical protein  34.33 
 
 
298 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  35.93 
 
 
935 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  36.93 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3496  hypothetical protein  36.21 
 
 
557 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.359328  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  34.67 
 
 
428 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  34.15 
 
 
1226 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3479  protein of unknown function DUF1533  32.49 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  26.29 
 
 
554 aa  77  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  39.81 
 
 
1821 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  44.44 
 
 
1009 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  42.53 
 
 
556 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  39.47 
 
 
981 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  27.98 
 
 
625 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  35.81 
 
 
640 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  34.23 
 
 
437 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  35.87 
 
 
1300 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  37.78 
 
 
1732 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  36.59 
 
 
372 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  31.65 
 
 
576 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  39.36 
 
 
600 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  36.94 
 
 
1937 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  36.94 
 
 
1467 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  37.66 
 
 
526 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  36.36 
 
 
2638 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  39.08 
 
 
462 aa  50.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.28 
 
 
4630 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  42.42 
 
 
1048 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  39.02 
 
 
1418 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.97 
 
 
1831 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  32.95 
 
 
983 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.47 
 
 
790 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 
570 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  29.3 
 
 
570 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  36.71 
 
 
220 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>