More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0361 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
549 aa  1117    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  40.92 
 
 
414 aa  347  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  32.76 
 
 
421 aa  232  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  31.96 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  49.58 
 
 
704 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 
781 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  26.47 
 
 
456 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  44.63 
 
 
741 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  63.16 
 
 
609 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  39.84 
 
 
754 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  32.49 
 
 
749 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  43.55 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  45.83 
 
 
763 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  39.67 
 
 
1118 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  53.85 
 
 
573 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  57.29 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  57.29 
 
 
603 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  55.77 
 
 
614 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  39.07 
 
 
383 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  50.48 
 
 
594 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  38.58 
 
 
758 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  47.11 
 
 
577 aa  108  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  52.04 
 
 
573 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  52.48 
 
 
582 aa  108  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38642  predicted protein  46.67 
 
 
587 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.429359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  52.04 
 
 
630 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  54.08 
 
 
613 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  57.89 
 
 
590 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  57.58 
 
 
597 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  51.79 
 
 
591 aa  107  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51 
 
 
651 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  53.06 
 
 
602 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  53.06 
 
 
602 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  52 
 
 
629 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  49.53 
 
 
600 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  53.06 
 
 
603 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  49.51 
 
 
623 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  49.51 
 
 
623 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  53.06 
 
 
602 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  40.16 
 
 
784 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  49.51 
 
 
623 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  47.66 
 
 
602 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.08 
 
 
577 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.17 
 
 
624 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  47.66 
 
 
602 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  47.66 
 
 
602 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  51.02 
 
 
654 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.43 
 
 
577 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  49.51 
 
 
623 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  50 
 
 
631 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  49.51 
 
 
623 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  47.66 
 
 
602 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  49.51 
 
 
623 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51.02 
 
 
623 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.02 
 
 
623 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  47.12 
 
 
592 aa  105  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  51.02 
 
 
623 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  51.02 
 
 
623 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  51.02 
 
 
623 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  51.02 
 
 
623 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  49.54 
 
 
650 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  48.51 
 
 
602 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3812  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  56.12 
 
 
610 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  53.06 
 
 
662 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1390  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  57.45 
 
 
585 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  53.06 
 
 
663 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1110  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  57.45 
 
 
585 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1935  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  50 
 
 
606 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  57.45 
 
 
721 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  40 
 
 
588 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  52.63 
 
 
656 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  47.66 
 
 
602 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  53.06 
 
 
655 aa  104  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44710  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  55.1 
 
 
596 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  49.51 
 
 
623 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  54.46 
 
 
600 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  52.48 
 
 
587 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  54.17 
 
 
600 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  42.02 
 
 
429 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  46.73 
 
 
600 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52 
 
 
597 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  44.64 
 
 
746 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  52.88 
 
 
618 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  56.12 
 
 
581 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  46.73 
 
 
601 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  46.73 
 
 
601 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.02 
 
 
582 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  52.88 
 
 
618 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  46.73 
 
 
601 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50 
 
 
603 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  55.79 
 
 
590 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  50.5 
 
 
597 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  51.43 
 
 
590 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  46.15 
 
 
581 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  40.83 
 
 
751 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  53.47 
 
 
622 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.57 
 
 
600 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  42.97 
 
 
588 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  48.51 
 
 
600 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  54.55 
 
 
581 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>