121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1271 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  100 
 
 
884 aa  1795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  25.56 
 
 
909 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
854 aa  141  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
928 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
916 aa  123  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.94 
 
 
1162 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
1162 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.43 
 
 
828 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 
991 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 
2741 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
1060 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.49 
 
 
2741 aa  99.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  23.61 
 
 
893 aa  99  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 
729 aa  97.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
1025 aa  94.4  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.92 
 
 
1009 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
796 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
851 aa  91.3  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.29 
 
 
532 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 
968 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.61 
 
 
919 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.04 
 
 
1328 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  43.56 
 
 
1054 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
883 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 
854 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  24.37 
 
 
1024 aa  84  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.62 
 
 
960 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  22.1 
 
 
717 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  28.62 
 
 
891 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
937 aa  80.9  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
905 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
905 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
1215 aa  78.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  28.42 
 
 
845 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 
1475 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
846 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
923 aa  78.2  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 
944 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  27.83 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
868 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  25.77 
 
 
903 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  25.67 
 
 
950 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  25.67 
 
 
950 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  21.66 
 
 
1025 aa  73.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  31.93 
 
 
840 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 
1365 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  23.71 
 
 
853 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
851 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
885 aa  69.3  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 
1544 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  23.55 
 
 
1051 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 
957 aa  68.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  22.38 
 
 
934 aa  67.8  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
822 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1409 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
1621 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  21.67 
 
 
989 aa  67.4  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
868 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  24.04 
 
 
725 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  23.91 
 
 
1039 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  22.62 
 
 
1219 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  21.09 
 
 
1051 aa  66.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.07 
 
 
1650 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
994 aa  64.7  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 
904 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  26.32 
 
 
565 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  21.48 
 
 
937 aa  61.6  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  32.95 
 
 
1507 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  24.1 
 
 
1246 aa  61.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  22.34 
 
 
447 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  19.52 
 
 
874 aa  60.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  24.17 
 
 
827 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.74 
 
 
2637 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 
1186 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  31.68 
 
 
192 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
1448 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.91 
 
 
992 aa  59.7  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.94 
 
 
1266 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  22.7 
 
 
1228 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  22.96 
 
 
1077 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  26.43 
 
 
1142 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  23.17 
 
 
689 aa  58.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  20.7 
 
 
643 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
1711 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  23.37 
 
 
1171 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
1055 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  21.57 
 
 
905 aa  56.6  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  26.82 
 
 
698 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.71 
 
 
1772 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.39 
 
 
3299 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  24.4 
 
 
918 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  26.14 
 
 
553 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
1036 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  26.95 
 
 
959 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  25.81 
 
 
811 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  22.57 
 
 
848 aa  51.6  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.82 
 
 
3537 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  20.68 
 
 
949 aa  51.2  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.79 
 
 
3298 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
1028 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>