173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3535 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 934 aa  1788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  38.3 
 
 		 937 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  33.13 
 
 		 989 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 1028 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  36.18 
 
 		 877 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 1507 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.9 
 
 		 1135 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 924 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 991 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1024 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 		 1288 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 		 1050 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 767 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 		 1424 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 725 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 923 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1025 aa  100  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 1290 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1105 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 568 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 568 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.39 
 
 		 1131 aa  98.2  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 444 aa  97.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1039 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 		 1186 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.22 
 
 		 1328 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.14 
 
 		 672 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 771 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.84 
 
 		 787 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1025 aa  90.5  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 751 aa  89  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1039 aa  87.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 212 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1215 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.58 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 885 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  28.74 
 
 		 963 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1051 aa  84  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 937 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.07 
 
 		 1044 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.4 
 
 		 799 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 1036 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 284 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 949 aa  81.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  26.06 
 
 		 1262 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.51 
 
 		 825 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  28.36 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  29.61 
 
 		 1056 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.66 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 1185 aa  78.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1259 aa  78.2  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 1054 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  19.9 
 
 		 1550 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 953 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1162 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 1162 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 911 aa  76.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  24.03 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.1 
 
 		 2741 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  19.05 
 
 		 2145 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 843 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 2741 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.75 
 
 		 1475 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 		 1128 aa  72.4  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  26.94 
 
 		 919 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.18 
 
 		 1488 aa  71.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1409 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 785 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 190 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 854 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.34 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  25.48 
 
 		 977 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.62 
 
 		 884 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.49 
 
 		 1060 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.4 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 		 1125 aa  69.3  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  31.66 
 
 		 893 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.71 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.38 
 
 		 822 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1212 aa  68.6  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.14 
 
 		 854 aa  68.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 851 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.38 
 
 		 1106 aa  68.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  26 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 916 aa  67.8  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 814 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 729 aa  67.4  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  22.45 
 
 		 960 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1283 aa  66.6  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 837 aa  65.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.29 
 
 		 841 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 854 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  21.36 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.32 
 
 		 717 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 469 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1068 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 851 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>