97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  100 
 
 		 1171 aa  2312    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1104 aa  359  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1142 aa  332  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 		 1363 aa  321  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 		 1476 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1096 aa  278  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1441 aa  266  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 997 aa  259  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 		 1114 aa  251  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1127 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 		 852 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1147 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1076 aa  198  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  36.98 
 
 		 1077 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1051 aa  125  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 747 aa  99.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1199 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  26.47 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  27.77 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 2741 aa  82  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.96 
 
 		 2741 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  26.01 
 
 		 845 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  26.57 
 
 		 827 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.78 
 
 		 1060 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1711 aa  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.39 
 
 		 893 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  25.06 
 
 		 903 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.63 
 
 		 840 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.5 
 
 		 991 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.56 
 
 		 532 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.08 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  23.37 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 1276 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1055 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  25.91 
 
 		 1219 aa  58.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.14 
 
 		 1007 aa  58.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.74 
 
 		 717 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 851 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  26.94 
 
 		 891 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 822 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1365 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 905 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 905 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.57 
 
 		 1009 aa  55.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 885 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1025 aa  54.3  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1054 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  31.2 
 
 		 371 aa  54.3  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1409 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1247 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  44.87 
 
 		 912 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  30.46 
 
 		 418 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 916 aa  52.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 		 937 aa  52.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 928 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 994 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1058 aa  52  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  34.81 
 
 		 897 aa  52  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  30.29 
 
 		 989 aa  51.6  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  29.07 
 
 		 877 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  31.52 
 
 		 934 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 729 aa  51.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 		 944 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.17 
 
 		 1475 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1779 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  29.23 
 
 		 960 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  27.54 
 
 		 909 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.91 
 
 		 853 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 878 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 937 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1119 aa  50.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.63 
 
 		 810 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  27.12 
 
 		 905 aa  48.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 796 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1192 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1241 aa  48.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  41.56 
 
 		 474 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1276 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 632 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 851 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 1162 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1544 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1162 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1621 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 854 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  40 
 
 		 2637 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 1448 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.68 
 
 		 1650 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 880 aa  45.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  29.81 
 
 		 447 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  23.56 
 
 		 992 aa  45.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 923 aa  45.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  23.14 
 
 		 950 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 		 874 aa  45.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  35.51 
 
 		 861 aa  45.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 		 957 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>