16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2673 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  100 
 
 
912 aa  1684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 
1363 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  29.67 
 
 
1104 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 
1476 aa  107  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 
997 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  27.27 
 
 
1096 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  30.48 
 
 
1441 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  27.89 
 
 
1142 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1114 aa  94.7  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  30.9 
 
 
1199 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  34.29 
 
 
1077 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  39.42 
 
 
1076 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  38.89 
 
 
1127 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
852 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  44.87 
 
 
1171 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  36.67 
 
 
1147 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>