28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3881 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  100 
 
 
1199 aa  2350    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  33.1 
 
 
1383 aa  201  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3105  hypothetical protein  29.41 
 
 
745 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.890364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  27.77 
 
 
877 aa  172  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  25.71 
 
 
862 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  27.59 
 
 
1196 aa  151  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  25.41 
 
 
1911 aa  142  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.87 
 
 
892 aa  135  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.48 
 
 
1142 aa  115  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  29.4 
 
 
1077 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  26.47 
 
 
1096 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 
997 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
1363 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  30.19 
 
 
1104 aa  99.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  29.5 
 
 
1500 aa  98.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  27.32 
 
 
1076 aa  98.6  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  26.36 
 
 
822 aa  98.2  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  27.01 
 
 
1127 aa  95.5  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
1476 aa  91.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 
1114 aa  87.4  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  26.32 
 
 
1171 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  33.59 
 
 
1509 aa  79  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  35.33 
 
 
912 aa  79  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  31.47 
 
 
1261 aa  74.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.05 
 
 
1523 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  23.78 
 
 
852 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  27.67 
 
 
1147 aa  65.1  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  28.17 
 
 
1441 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>