101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5349 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  42.3 
 
 		 1142 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  46.51 
 
 		 1104 aa  763    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  100 
 
 		 1441 aa  2802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 		 1363 aa  580  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 		 1476 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1096 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  29.72 
 
 		 997 aa  359  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1077 aa  336  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1076 aa  329  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 		 1114 aa  323  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1127 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 852 aa  271  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1147 aa  220  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1171 aa  166  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1051 aa  111  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1058 aa  99.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  30.6 
 
 		 565 aa  94.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  26.85 
 
 		 521 aa  94.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 		 1507 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  36.88 
 
 		 747 aa  86.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 994 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  30.16 
 
 		 912 aa  82.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.02 
 
 		 1007 aa  81.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  29.73 
 
 		 717 aa  78.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1199 aa  76.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1711 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1276 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.16 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  23.69 
 
 		 1044 aa  72  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  35.88 
 
 		 827 aa  67  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.12 
 
 		 991 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1060 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  36.49 
 
 		 903 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  29.84 
 
 		 1219 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  27.23 
 
 		 992 aa  64.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 916 aa  63.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1276 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 		 874 aa  62.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 729 aa  62  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1162 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 2741 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 1162 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.85 
 
 		 2741 aa  60.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.96 
 
 		 977 aa  59.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  36.61 
 
 		 873 aa  58.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 1779 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 1424 aa  57.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1409 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.92 
 
 		 1009 aa  56.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1365 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  34.92 
 
 		 474 aa  56.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1247 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  34.43 
 
 		 890 aa  55.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.31 
 
 		 532 aa  55.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  24.88 
 
 		 897 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  35.26 
 
 		 890 aa  54.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 		 632 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 937 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1025 aa  53.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  34.12 
 
 		 811 aa  54.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1105 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  45.21 
 
 		 1475 aa  53.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  31.39 
 
 		 822 aa  53.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 		 828 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  32 
 
 		 371 aa  52.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  37.97 
 
 		 897 aa  52.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  23.63 
 
 		 960 aa  52  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 751 aa  52  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 1128 aa  51.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1215 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.76 
 
 		 1328 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.47 
 
 		 809 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 924 aa  51.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1241 aa  50.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 		 919 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.98 
 
 		 840 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 851 aa  49.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 905 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1192 aa  49.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 846 aa  49.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 878 aa  49.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 905 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  29.06 
 
 		 599 aa  48.5  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1119 aa  48.5  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 		 968 aa  48.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 854 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.21 
 
 		 2637 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  30.18 
 
 		 595 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 953 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.02 
 
 		 810 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1290 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  28.76 
 
 		 596 aa  46.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1228 aa  46.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.62 
 
 		 853 aa  46.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.06 
 
 		 1050 aa  45.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  31.86 
 
 		 909 aa  45.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 902 aa  45.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 639 aa  45.1  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>