21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0438 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  100 
 
 
822 aa  1593    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  31.69 
 
 
1383 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  23.84 
 
 
862 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  24.29 
 
 
877 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  27.61 
 
 
1199 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  21.85 
 
 
892 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  23.77 
 
 
1196 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3105  hypothetical protein  24.01 
 
 
745 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.890364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  19.45 
 
 
1911 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  27.57 
 
 
1500 aa  71.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.58 
 
 
1523 aa  64.7  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.14 
 
 
1261 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  43 
 
 
1104 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.2 
 
 
1142 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 
1363 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 
1476 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  29.73 
 
 
1509 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  36.24 
 
 
1096 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 
997 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
1114 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  33.56 
 
 
1441 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>