51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6950 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  100 
 
 		 909 aa  1772    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1228 aa  190  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  34.08 
 
 		 1241 aa  184  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1051 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1276 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  37.93 
 
 		 565 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.58 
 
 		 1009 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  32.42 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.52 
 
 		 3537 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 905 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1077 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 905 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  27.66 
 
 		 521 aa  55.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.86 
 
 		 532 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37 
 
 		 1475 aa  54.7  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.85 
 
 		 717 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.15 
 
 		 3298 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.15 
 
 		 3419 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.15 
 
 		 3535 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  33.08 
 
 		 853 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  34.11 
 
 		 960 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 916 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 1186 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  30.08 
 
 		 192 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  32.06 
 
 		 950 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  32.06 
 
 		 950 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.51 
 
 		 3299 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  31.85 
 
 		 891 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 854 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 851 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 796 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1096 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 2741 aa  48.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.5 
 
 		 1772 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  36.62 
 
 		 992 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  22.63 
 
 		 852 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1171 aa  46.6  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1441 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.47 
 
 		 840 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 928 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.5 
 
 		 1650 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 2741 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 1448 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1162 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 1162 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 1363 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 991 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>