64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2355 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1782    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 		 937 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  36.18 
 
 		 934 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  32.96 
 
 		 989 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1028 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1024 aa  98.6  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1025 aa  96.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1051 aa  84.3  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 923 aa  84  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.82 
 
 		 1135 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1259 aa  76.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 1162 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.54 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1162 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 916 aa  71.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 854 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1054 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  35.51 
 
 		 903 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  40 
 
 		 1039 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1215 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  31.15 
 
 		 944 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 2741 aa  58.9  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1025 aa  58.9  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  29.34 
 
 		 893 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1036 aa  58.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 937 aa  58.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.65 
 
 		 1328 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1409 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.42 
 
 		 2741 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 1186 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 729 aa  55.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.65 
 
 		 919 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 846 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  29.5 
 
 		 717 aa  52.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 905 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 905 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 851 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.22 
 
 		 828 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  32.41 
 
 		 874 aa  51.2  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 949 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 868 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1060 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 		 991 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  35.14 
 
 		 861 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1171 aa  49.7  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 994 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  28.44 
 
 		 853 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 1475 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 1247 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 1711 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 968 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  31.4 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.19 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 1779 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 851 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  32.81 
 
 		 521 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.15 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 1365 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1077 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.45 
 
 		 840 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  27.54 
 
 		 891 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  30.37 
 
 		 845 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 957 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>