25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6701 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6701  hypothetical protein  100 
 
 		 675 aa  1319    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  25.98 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 883 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  23.37 
 
 		 944 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  31.21 
 
 		 903 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  22.84 
 
 		 2637 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 822 aa  54.3  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 2741 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1779 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 1247 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 		 2741 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.45 
 
 		 853 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  27.88 
 
 		 937 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.23 
 
 		 1772 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 846 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 928 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1054 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 885 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1162 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 1162 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1246 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  20.22 
 
 		 796 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>