24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0117 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 457 aa  911    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  84.9 
 
 		 475 aa  787    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  69.8 
 
 		 454 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  49.19 
 
 		 450 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  27.38 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  28.25 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  29.74 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  27.27 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.61 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  25.86 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.46 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  30.51 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  25.33 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.47 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  27.59 
 
 		 338 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  24.29 
 
 		 286 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  26.34 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.22 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  26.59 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  26.59 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  29.14 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.79 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  25.4 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  24.66 
 
 		 313 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>