134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0795 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  45.49 
 
 
334 aa  198  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  37.25 
 
 
361 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  35.69 
 
 
282 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  43.98 
 
 
286 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  35.44 
 
 
284 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  32.26 
 
 
276 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  28.19 
 
 
294 aa  82  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.89 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  34.09 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  30.54 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  30.54 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  32.35 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  27.23 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  30.17 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  29.49 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  29.44 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  27.23 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  29.38 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  29.33 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  33.55 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  32.52 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  36.13 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  28.1 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  38.52 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  27.37 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  37.86 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  24.58 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3156  hypothetical protein  30.53 
 
 
533 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  31.98 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1976  hypothetical protein  30.53 
 
 
533 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.188319  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  32.74 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.3 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  28.5 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  32.74 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  29.85 
 
 
533 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  24.73 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  29.85 
 
 
533 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2158  hypothetical protein  29.75 
 
 
533 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  29.63 
 
 
533 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  28.23 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  29.63 
 
 
533 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  29.63 
 
 
533 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  30.3 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  25.35 
 
 
393 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  31.43 
 
 
393 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  29.44 
 
 
356 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  31.45 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  34.29 
 
 
216 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05660  hypothetical protein  29.95 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  28.43 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  34.62 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.5 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1955  hypothetical protein  28.89 
 
 
533 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  33.6 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.22 
 
 
211 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  34.19 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  24.24 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
365 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  33.6 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  30.89 
 
 
259 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  25.4 
 
 
259 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  29.75 
 
 
367 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  23.75 
 
 
195 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  23.75 
 
 
195 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  33.59 
 
 
222 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  27.61 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  32.82 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  27.61 
 
 
254 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0028  alpha/beta fold family lipase  24.88 
 
 
200 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  28.3 
 
 
378 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06481  lipase family protein  24.88 
 
 
200 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.15202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  31.48 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  29.66 
 
 
239 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  39.73 
 
 
1602 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1108  hypothetical protein  29.9 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0947  hypothetical protein  30.84 
 
 
683 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119116  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  27.52 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11350  PGAP1 family protein  25.38 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  27.27 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83712  predicted protein  27.5 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  28.46 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  33.33 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1995  PGAP1 family protein  28.23 
 
 
536 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0402712  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  38.1 
 
 
561 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  28.1 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  25.79 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  31.73 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  33.33 
 
 
743 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  29.36 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>