201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2328 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  67.42 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  56.05 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  47.67 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  52.36 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  52.83 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  45.63 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  50.66 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  49.19 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  48.78 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  48.78 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  48.37 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  48.33 
 
 		 263 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  51.8 
 
 		 238 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  47.9 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  47.41 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  48.23 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  48.2 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  47.83 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  49.55 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  48.23 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  45.42 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  47.16 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  47.73 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  46.9 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  45.21 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  45.16 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  44.89 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  40.96 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  44.64 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  43.38 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  43.5 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  41.48 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  43.81 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  42.97 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  43.57 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  43.86 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  44.76 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  41.78 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  42.5 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  44.04 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  42.75 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  43.58 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  39.04 
 
 		 230 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  42.01 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  41.78 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  38.86 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  43.72 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  42.66 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  42.66 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  39.21 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  39.09 
 
 		 230 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  41.1 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  39.74 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  40.89 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  41.07 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  41.52 
 
 		 252 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  42.02 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  41.96 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  41.07 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  39.11 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  40.29 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  40.87 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  36.61 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  39.13 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  37.21 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  40.54 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  39 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  38.5 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  41.04 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  38.96 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  41.63 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  40.85 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  38.94 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  38.81 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  38.2 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  36.17 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  33.62 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  34.23 
 
 		 147 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  34.23 
 
 		 147 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  32.24 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.21 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  30.28 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  27.16 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10320  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.95 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>