153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2733 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  81.42 
 
 
230 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  80.97 
 
 
232 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  75.98 
 
 
231 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  77.29 
 
 
230 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  75.44 
 
 
230 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  71.05 
 
 
231 aa  344  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  74.88 
 
 
231 aa  329  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  44.84 
 
 
256 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  43.95 
 
 
256 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  43.5 
 
 
266 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  41.52 
 
 
289 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  42.6 
 
 
332 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  44.65 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  39.21 
 
 
259 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  43.5 
 
 
257 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  39.64 
 
 
257 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  42.08 
 
 
252 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  42.6 
 
 
244 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  39.11 
 
 
257 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  42.67 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  43.29 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  40.18 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  39.19 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  41.7 
 
 
276 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  43.93 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  39.04 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  40.09 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  40.87 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  38.67 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  40.36 
 
 
276 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  37.67 
 
 
226 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  42.15 
 
 
250 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  40.18 
 
 
276 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  40.18 
 
 
276 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  38.22 
 
 
255 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  42.53 
 
 
255 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  39.01 
 
 
268 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  40.76 
 
 
263 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  40.76 
 
 
263 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  38.74 
 
 
262 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  40.76 
 
 
263 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  39.91 
 
 
256 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  40.99 
 
 
259 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  38.91 
 
 
259 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  37.61 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  39.81 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  39.81 
 
 
263 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  39.64 
 
 
252 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  39.19 
 
 
260 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  36.65 
 
 
260 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  36.65 
 
 
231 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  39.64 
 
 
259 aa  148  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  39.19 
 
 
252 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  36.61 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  38.53 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  39.04 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  39.91 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  41.9 
 
 
256 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  41.08 
 
 
286 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  39.11 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  39.19 
 
 
259 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  38.84 
 
 
257 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  36.97 
 
 
249 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  39.48 
 
 
255 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  37.27 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  37.87 
 
 
258 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  41.15 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  37.39 
 
 
278 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  36.28 
 
 
231 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 
279 aa  135  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
271 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  36.24 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  39.41 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  34.91 
 
 
257 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  36.16 
 
 
267 aa  128  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  36.44 
 
 
234 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  39.18 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  35.5 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
255 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  34.38 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  35.59 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  36.84 
 
 
200 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  35.78 
 
 
257 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  36.81 
 
 
147 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  36.81 
 
 
147 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  30.9 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.83 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  30.25 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  25.21 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  30.21 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  30.21 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 
245 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>