130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2190 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  78.91 
 
 		 257 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  82.83 
 
 		 259 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  79.15 
 
 		 260 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  75.29 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  81.66 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  73.73 
 
 		 255 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  77.25 
 
 		 259 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  59.91 
 
 		 268 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  49.12 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  47.98 
 
 		 262 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  43.57 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  42.63 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  43.15 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  48 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  43.25 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  43.15 
 
 		 263 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  43.7 
 
 		 252 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  43.25 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  49.1 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  46.19 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  42.4 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  42.4 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  43.48 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  49.1 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  46.23 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  45.69 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  38.76 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  45.75 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  46.51 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  45.78 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  47.37 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  40.54 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  43.72 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  42.68 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 244 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  47.27 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  45.78 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  41.59 
 
 		 226 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  47.49 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  39.18 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  45.45 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  44.05 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  45.24 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  42.39 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  44.64 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  40.45 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  43.69 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  38.7 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  42.79 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  38.67 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  43.33 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  40.35 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  41.74 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  38.59 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  41.1 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  38.7 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  37.55 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  37.39 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  36.29 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  38.67 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  40.71 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  38.28 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  37.55 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  37.22 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  37.5 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  35.87 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  35.43 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  33.78 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  36.32 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  34.86 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  35.59 
 
 		 231 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  34.42 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  36.29 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  35.86 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  34.68 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  39.01 
 
 		 147 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  39.01 
 
 		 147 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  35.16 
 
 		 200 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  30.92 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  29.17 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  28.51 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  28.23 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  28.23 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  28.23 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.8 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>