136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3124 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  94.87 
 
 		 266 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  68.49 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  53.33 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  52.65 
 
 		 257 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  51.49 
 
 		 256 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  50.87 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  51.32 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  55.26 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  53.07 
 
 		 257 aa  225  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  50.22 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  51.54 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  51.54 
 
 		 276 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  51.54 
 
 		 276 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  47.53 
 
 		 262 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  49.11 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  48.76 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  46.09 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  50.24 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  47.5 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  49.34 
 
 		 252 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  48.2 
 
 		 259 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  48.2 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  49.1 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  46.96 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  42.15 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  47.53 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  48.03 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  50.68 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  47.26 
 
 		 259 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  46.78 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  46.81 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  46.72 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  50.71 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  46.85 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  47.62 
 
 		 259 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  49.52 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  49.52 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  45.11 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  47.58 
 
 		 252 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  46.05 
 
 		 226 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  46.12 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  44.54 
 
 		 259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  43.05 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  44.73 
 
 		 264 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  46.15 
 
 		 238 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  45.06 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  42.22 
 
 		 255 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  42.73 
 
 		 230 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  41.44 
 
 		 232 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  43.17 
 
 		 244 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  43.56 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  41.89 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  44.29 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  41.59 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  42.15 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  43.04 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  40.43 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 		 255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  40.81 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  42.11 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  41.67 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  38.5 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  40.35 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  37.33 
 
 		 236 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  42.92 
 
 		 283 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  37.83 
 
 		 257 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  37.22 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  39.21 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  33.91 
 
 		 234 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  41.18 
 
 		 233 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  37.12 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  36.96 
 
 		 234 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  38.64 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  38.26 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  39.57 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  37.96 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  40.82 
 
 		 147 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  37.86 
 
 		 200 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  28.39 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.51 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  34.62 
 
 		 235 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  32.31 
 
 		 241 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  25.83 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>