131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2823 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  75 
 
 		 260 aa  358  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  74.32 
 
 		 261 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  52.8 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  50.6 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  50.43 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  50.89 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  44.18 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  52.23 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  50.66 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  52.23 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  52.23 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  46.54 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  50.22 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  50.89 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  45.88 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  48.92 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  48.92 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  49.37 
 
 		 282 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  43.97 
 
 		 289 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  46.22 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  46.75 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  46.72 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  43.72 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  45.45 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  47.53 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  46.64 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  47.58 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  46.32 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  45.34 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  45.29 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  41.96 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  46.64 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  42.91 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  43.72 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  43.72 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  45.81 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  44.9 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  45.37 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  44.84 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  44.3 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  44.3 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  41.7 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  44.26 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  43.6 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  44.74 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  42.73 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  44.74 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  43.64 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  42.92 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  42.34 
 
 		 226 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  42.37 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  42.53 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  36.58 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  41.15 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  37.45 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  36.56 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  40.61 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  43.67 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  38.02 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  40.74 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  38.29 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  38.98 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  38.08 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  37.17 
 
 		 232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  36.94 
 
 		 230 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  39.29 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  37.82 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  35.84 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  36.22 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  39.04 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  38.22 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  35.75 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  38.22 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  39.52 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  35.09 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  38.26 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  38.07 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  37.17 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  34.03 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  26.61 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  30.89 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  26.82 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  25.32 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  26.05 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 242 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>