133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1452 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  84.17 
 
 
259 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  82.17 
 
 
259 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  84.11 
 
 
259 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  73.93 
 
 
255 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  73.64 
 
 
278 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  73.05 
 
 
260 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  69.14 
 
 
257 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  61.33 
 
 
268 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  48.65 
 
 
266 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  48.23 
 
 
259 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  44.76 
 
 
255 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  44.4 
 
 
263 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  43.98 
 
 
263 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  45.04 
 
 
257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  43.15 
 
 
263 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  44 
 
 
259 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  46.82 
 
 
263 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  48.2 
 
 
332 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  43.95 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  42.61 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  43.55 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  45.3 
 
 
261 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  40.55 
 
 
262 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  43.91 
 
 
256 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  44.04 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  47.64 
 
 
256 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  46.02 
 
 
309 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  38.28 
 
 
259 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  44.39 
 
 
265 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  41.6 
 
 
270 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  44.95 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  45.22 
 
 
256 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  40.78 
 
 
252 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  42.73 
 
 
282 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  43.15 
 
 
255 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  40.68 
 
 
276 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  39.38 
 
 
226 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  43.3 
 
 
264 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  45.91 
 
 
252 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  36.96 
 
 
289 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  45.33 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  43.86 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  40.25 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  40.25 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  41.84 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  39.46 
 
 
234 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  44.14 
 
 
256 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  41.63 
 
 
276 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  44.29 
 
 
256 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  44.44 
 
 
259 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  43.37 
 
 
267 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  40.99 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  42.38 
 
 
256 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  40.79 
 
 
257 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  38.26 
 
 
257 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  38.74 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  38.84 
 
 
236 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  36.14 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  37.99 
 
 
249 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  39.13 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  39.71 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  38.06 
 
 
268 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  39.01 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  39.21 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  36.77 
 
 
231 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 
286 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  37.56 
 
 
230 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 
279 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  37.1 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  37.84 
 
 
231 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  36.94 
 
 
230 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  35.29 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  34.9 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  38.22 
 
 
234 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  35.87 
 
 
231 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  36.16 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  35.51 
 
 
233 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
258 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  36.71 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  36.24 
 
 
249 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  36.04 
 
 
257 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 
271 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  34.62 
 
 
200 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  32.64 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  32.64 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  28.22 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  31.03 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  29.79 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  31.17 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.2 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  32.78 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  27.23 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>