95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4871 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  97.28 
 
 
276 aa  289  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  75.52 
 
 
276 aa  226  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  75.52 
 
 
276 aa  226  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  75.52 
 
 
276 aa  226  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  62.94 
 
 
289 aa  196  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  58.74 
 
 
257 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  66.43 
 
 
257 aa  179  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  63.89 
 
 
257 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  42.47 
 
 
309 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  42.57 
 
 
266 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  39.46 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  44.36 
 
 
263 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  42.86 
 
 
263 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  41.91 
 
 
263 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  42.11 
 
 
263 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  39.31 
 
 
260 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  38.46 
 
 
259 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  39.01 
 
 
278 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  40.6 
 
 
263 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  39.85 
 
 
263 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  34.23 
 
 
259 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  37.93 
 
 
257 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  38.89 
 
 
231 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  38.1 
 
 
259 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  35.92 
 
 
262 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  39.69 
 
 
256 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  38.35 
 
 
233 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  35.86 
 
 
252 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  36.81 
 
 
229 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  34.75 
 
 
259 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  36.55 
 
 
255 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  32.88 
 
 
257 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  34.97 
 
 
259 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  35.17 
 
 
238 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  34 
 
 
261 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  36.73 
 
 
250 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  35 
 
 
236 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  33.11 
 
 
231 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  34.01 
 
 
255 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  36.05 
 
 
232 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  39.61 
 
 
260 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  35.81 
 
 
268 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  32.89 
 
 
255 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  35.95 
 
 
234 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  30.71 
 
 
226 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  35.37 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  34.75 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  33.1 
 
 
234 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  35.86 
 
 
252 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
279 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  34.97 
 
 
230 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  32.35 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  35.17 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  30.92 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  34.27 
 
 
256 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  35.21 
 
 
230 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  35.88 
 
 
256 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  34.27 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  35.42 
 
 
232 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  34.04 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  35.67 
 
 
286 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  35.51 
 
 
267 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  35.42 
 
 
282 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  30.07 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  33.56 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  31.76 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  30.07 
 
 
268 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  31.61 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  33.59 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 
258 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  31.33 
 
 
264 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  33.55 
 
 
259 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  32.68 
 
 
283 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  29.61 
 
 
249 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10320  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 
258 aa  57.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  30.14 
 
 
264 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
258 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  28.48 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  30.5 
 
 
257 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
271 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07982  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0159606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
278 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  30.07 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02942  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  31.41 
 
 
242 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  32.28 
 
 
242 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>