171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2246 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  79.75 
 
 
242 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  79.75 
 
 
242 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  40.42 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  34.87 
 
 
238 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  35.27 
 
 
245 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  31.22 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
241 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  31.58 
 
 
256 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  31.58 
 
 
256 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  31.73 
 
 
256 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
278 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  32.97 
 
 
294 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  32.97 
 
 
294 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
294 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  32.97 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  33.81 
 
 
301 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
311 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  31.44 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  31.91 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
294 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  32.73 
 
 
301 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
292 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  32.37 
 
 
336 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  32.37 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  32.73 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  32.73 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  32.73 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  32.73 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.8 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  27.08 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  26.15 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  34.69 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  27.35 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  27.16 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  27.52 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  37.7 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  37.7 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  37.7 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  27.17 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.51 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  30.25 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  26.13 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  29.08 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  26.53 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  28.51 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  36.29 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  27.69 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  25.1 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  26.61 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  26.36 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  35.48 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  27.68 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  28.76 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  27.68 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.65 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  28.46 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  30.96 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  29.87 
 
 
276 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3816  hypothetical protein  31.88 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  29.87 
 
 
276 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8879  hypothetical protein  27.04 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  27.78 
 
 
276 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  28.99 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  28.93 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  29.44 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  26.8 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  30.7 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  33.06 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  28.69 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  25.86 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  27.08 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  26.55 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  27.54 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  33.9 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  27.83 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  26.46 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  25.69 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  26.5 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
279 aa  58.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  27 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  26.46 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23670  hypothetical protein  29.74 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.172627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  28.33 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  24.1 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  28.44 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  27.02 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  25 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  28.99 
 
 
195 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
277 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  25 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>