118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5922 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  88.03 
 
 
259 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  85.27 
 
 
259 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  84.11 
 
 
259 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  76.74 
 
 
278 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  74.51 
 
 
255 aa  390  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  71.88 
 
 
257 aa  377  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  74.61 
 
 
260 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  63.56 
 
 
268 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  47.03 
 
 
257 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  48.03 
 
 
259 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  43.6 
 
 
255 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  45.19 
 
 
263 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  44.77 
 
 
263 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  46.72 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  46.79 
 
 
238 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  43.93 
 
 
263 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  42.52 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  44.12 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  43.7 
 
 
263 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  43.93 
 
 
261 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  46.72 
 
 
332 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  44.78 
 
 
256 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  40.73 
 
 
259 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  48.88 
 
 
256 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  42.92 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  40.64 
 
 
263 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  46.93 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  42.58 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  45.98 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  42.98 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  41.18 
 
 
270 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  42.54 
 
 
276 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  42.54 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  40.09 
 
 
257 aa  178  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  41.86 
 
 
252 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  43.21 
 
 
255 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  43.44 
 
 
276 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  38.5 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  38.22 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  46.36 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  42.11 
 
 
244 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  39.52 
 
 
282 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  40.5 
 
 
256 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  36.52 
 
 
234 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  41.04 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  43.72 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  44.55 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  43.25 
 
 
267 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  43.53 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  42.15 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  42.08 
 
 
260 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  44.34 
 
 
256 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  42.65 
 
 
256 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  39.91 
 
 
257 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  39.39 
 
 
257 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  39.19 
 
 
229 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  41.83 
 
 
231 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  38.84 
 
 
236 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  39.19 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  38.57 
 
 
232 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 
279 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  37.84 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  40.62 
 
 
230 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  36.94 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  38.7 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  36.68 
 
 
286 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  37.84 
 
 
230 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  36.04 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  39.11 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  37.64 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  34.62 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  36.68 
 
 
249 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  36.77 
 
 
231 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
274 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  36.28 
 
 
231 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  38.16 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  34.82 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  35.81 
 
 
283 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  36.77 
 
 
257 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  35.04 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  36.61 
 
 
200 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  34.97 
 
 
147 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  34.97 
 
 
147 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  28.51 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  30.4 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.36 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  25.7 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.71 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  28.09 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  29.3 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  29.3 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>