139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6228 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  58.42 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  49.56 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  47.6 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  46.88 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  47.44 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  46.93 
 
 		 274 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  46.75 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  48.07 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  42.68 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  47.44 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  46.12 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  48.02 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  45.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  43.7 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  43.67 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  38.96 
 
 		 257 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  40.54 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  41.07 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  41.23 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  44.3 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  42.04 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  44.24 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  44.3 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  40.18 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  39.64 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  40.18 
 
 		 259 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  42.13 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  37.17 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  40.91 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  36.04 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  38.94 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  39.21 
 
 		 309 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  35.84 
 
 		 289 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  37.17 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  38.94 
 
 		 276 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  39.06 
 
 		 264 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  31.62 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  38.74 
 
 		 332 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  37.33 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  39.38 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  38.68 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  39.73 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  38.68 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  36.16 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  35.24 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  38.68 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  36.24 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  38.21 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  38.33 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  38.21 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  37.44 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  39.56 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  36.16 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  35.06 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  37.78 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  36.16 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  37.17 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  36.56 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  36.56 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  35.62 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  39.37 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  36.28 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  36.99 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  38.67 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  37.22 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  37.23 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  34.7 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  32.14 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  34.38 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  37.27 
 
 		 255 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  36.32 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  36.73 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  34.21 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  35.09 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  33.48 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  30.87 
 
 		 270 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  36.57 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  32.75 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  37.45 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  34.67 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  34.12 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  36.45 
 
 		 233 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  34.12 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 278 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  35.42 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  35.42 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  31.62 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.45 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6798  hypothetical protein  50 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.13 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  27.88 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8879  hypothetical protein  29.54 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3816  hypothetical protein  31.86 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  29.8 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>