195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2788 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  51.21 
 
 
278 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  39.53 
 
 
235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
235 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  124  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  32.88 
 
 
294 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
311 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
294 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  30.56 
 
 
301 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
294 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  32.44 
 
 
294 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  31.55 
 
 
237 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  32.44 
 
 
294 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  30.16 
 
 
336 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  29.76 
 
 
336 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  29.76 
 
 
309 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  29.76 
 
 
301 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  29.76 
 
 
301 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  29.76 
 
 
301 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  29.76 
 
 
301 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  29.17 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  28.43 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  27.32 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  26.51 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  31.76 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.32 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  33.53 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  32 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  31.73 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  30.39 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  34.12 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  30.06 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  27.35 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  26.22 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  30.7 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  30.27 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  32.35 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02942  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  30.1 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  28.8 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  44.12 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  30.35 
 
 
263 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  31.02 
 
 
270 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  30.2 
 
 
265 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  42.86 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  41.98 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  44.93 
 
 
223 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  44.93 
 
 
223 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.67 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  24.4 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  30.36 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  37.96 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  27.5 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  30.73 
 
 
320 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
292 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
274 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  41.98 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  43.08 
 
 
223 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  41.98 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  31.18 
 
 
256 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  27.98 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  42.86 
 
 
267 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  28.72 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  28.5 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  26.36 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  28.11 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  24.12 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  51.16 
 
 
247 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  47.92 
 
 
243 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  38.1 
 
 
273 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10320  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.7 
 
 
371 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  25.91 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  25.91 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  28.85 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  25.28 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 
277 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  29.41 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  29.63 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  27.84 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  48.94 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  25.41 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.61 
 
 
371 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.61 
 
 
371 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  29.52 
 
 
263 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  29.52 
 
 
263 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  45.45 
 
 
283 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>