49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1962 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  100 
 
 
308 aa  634    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  48.91 
 
 
310 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  51.36 
 
 
277 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  46.37 
 
 
320 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 
292 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  35.88 
 
 
301 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  35.88 
 
 
336 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  35.88 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  35.88 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  35.88 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  35.88 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  35.88 
 
 
336 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  35.88 
 
 
309 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  33.1 
 
 
294 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  33.1 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
294 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  33.22 
 
 
294 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
294 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
311 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2474  esterase  48.45 
 
 
100 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534275  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.2 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.31 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  24.82 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
208 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  33.06 
 
 
246 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  25.56 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  26.01 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  27.18 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  44.23 
 
 
229 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  27.73 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  27.73 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  27.73 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  28.27 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  44.44 
 
 
231 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  44.44 
 
 
231 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  26.95 
 
 
223 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  26.95 
 
 
223 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  26.67 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>