82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4939 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  39.78 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  39.43 
 
 
294 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  39.3 
 
 
294 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 
294 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  37.59 
 
 
301 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
277 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  38.55 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  38.55 
 
 
336 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  38.64 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  37.64 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
292 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  38.11 
 
 
310 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  32.26 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
240 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  32.26 
 
 
242 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  32.73 
 
 
242 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  30.94 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  30.94 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  30.94 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.68 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.5 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  31.79 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  23.27 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  28.36 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  24.2 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  25.7 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  26.55 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  34.38 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  28.1 
 
 
230 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  28.16 
 
 
230 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  27.9 
 
 
229 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.25 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  28.1 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  36.07 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  34.88 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  29.26 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  26.98 
 
 
246 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  27.41 
 
 
232 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2474  esterase  40.79 
 
 
100 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534275  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  25.54 
 
 
244 aa  48.9  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  26.64 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  36.29 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  26.91 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  26.74 
 
 
241 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  32.79 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  27.33 
 
 
231 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  29.24 
 
 
230 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  28.36 
 
 
231 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  33.06 
 
 
224 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  27.27 
 
 
229 aa  45.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  32.5 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  29.18 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  27.64 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.97 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  35.11 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  25.95 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  23.08 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.09 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  29.71 
 
 
240 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  25.46 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>