155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0222 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  79.67 
 
 
244 aa  410  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  52.3 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  51.64 
 
 
241 aa  207  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  46.94 
 
 
243 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  45.19 
 
 
246 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  42.36 
 
 
267 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.15 
 
 
235 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  39.84 
 
 
273 aa  161  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  38.78 
 
 
241 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  40.33 
 
 
239 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  37.5 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  34.68 
 
 
229 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  34.69 
 
 
231 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  34.27 
 
 
231 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  34.69 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  39.26 
 
 
237 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  35.12 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  35.95 
 
 
224 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  35.12 
 
 
225 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  35 
 
 
248 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  31.54 
 
 
243 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  56.19 
 
 
267 aa  121  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  37.5 
 
 
240 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  34.3 
 
 
237 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  45.26 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  45.26 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  45.26 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  33.2 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  32.39 
 
 
241 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  34.29 
 
 
241 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  32.14 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  45.87 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
237 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  28.17 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  25.94 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  26.42 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  28.28 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  24.81 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  37.38 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  27.43 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  24.43 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  24.43 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  25.76 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.48 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  25.76 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  26.95 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  26.43 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  29.54 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  26.09 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  26.07 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.03 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  26.86 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  28.85 
 
 
261 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  33.81 
 
 
221 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  33.86 
 
 
336 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  33.86 
 
 
336 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  33.86 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  26.72 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  33.86 
 
 
301 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  33.86 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  33.86 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  33.86 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  33.86 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  31.54 
 
 
120 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
246 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31050  hypothetical protein  30.41 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00870089  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
311 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8879  hypothetical protein  30.95 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  26.52 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  24.19 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
292 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  25.97 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  37.74 
 
 
257 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  35.19 
 
 
276 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  32.43 
 
 
259 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
294 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
304 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
304 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  35.09 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  34.26 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  34.26 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  33.64 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  34.45 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  34.55 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  35.04 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>