More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1001 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  46.41 
 
 
243 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  43.35 
 
 
246 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.95 
 
 
235 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  44.87 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  38.72 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  39.75 
 
 
244 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  41.04 
 
 
243 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  36.17 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  42.5 
 
 
234 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  40 
 
 
241 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  37.78 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  37.24 
 
 
224 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  40.24 
 
 
239 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  30.86 
 
 
231 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  32.23 
 
 
229 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  44.09 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  44.09 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  37.01 
 
 
267 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  37.82 
 
 
222 aa  132  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  37.72 
 
 
223 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  34.03 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  35.22 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  34.85 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  35 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  36.84 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  36.84 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  36.55 
 
 
241 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  33.47 
 
 
248 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  35.27 
 
 
241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  31.05 
 
 
248 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  31.25 
 
 
238 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  42.86 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  40.35 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  40.54 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  29.84 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  31.82 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  35.2 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  38.66 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  34.94 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  34.94 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  34.94 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  34.94 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  34.94 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  34.94 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  34.34 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  37.88 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  29.75 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  38.24 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  38.89 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  35.48 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  32.79 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  36.29 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  38.89 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  33.33 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  33.33 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  28.1 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  27.53 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  37.04 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  37.04 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  37.04 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  28.95 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  26.62 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  28.8 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8879  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  39.47 
 
 
239 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
208 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
294 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  40.74 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  34.82 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  35.04 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  32.76 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  42 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  33.33 
 
 
294 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  26.67 
 
 
222 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.92 
 
 
271 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  27.49 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  35.45 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  26.69 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  27.92 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  34.45 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  35.59 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  35.09 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  37.19 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>