212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4366 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  100 
 
 
241 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  50.82 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  52.99 
 
 
234 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  47.95 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  46.22 
 
 
246 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  47.28 
 
 
243 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  35.98 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.19 
 
 
235 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  36.51 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  36.59 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  35.71 
 
 
248 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  34.03 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  35.11 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  52.25 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  52.25 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  50.45 
 
 
231 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  50.45 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  36.73 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  37.5 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  35.71 
 
 
237 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  33.05 
 
 
224 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  37.29 
 
 
240 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  53.21 
 
 
267 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  35.27 
 
 
225 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  34.15 
 
 
241 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  36.12 
 
 
223 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  33.62 
 
 
222 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  35.87 
 
 
223 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  35.87 
 
 
223 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  34.18 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.47 
 
 
235 aa  89  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  34.13 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
235 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  46.49 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  29.57 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  46.36 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  31.85 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  27.51 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  28.92 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  31.4 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  37.84 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  32.79 
 
 
195 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  48.54 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.88 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  25.3 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  38.4 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  38.46 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  26.85 
 
 
301 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  28.22 
 
 
294 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  37.29 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  28.06 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  37.4 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  43.9 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  36.29 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  34.85 
 
 
336 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  34.85 
 
 
336 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 
258 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  36.89 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  37.62 
 
 
120 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  38.26 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  34.85 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  34.85 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  34.85 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  34.85 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  34.85 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  39.17 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  37.93 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  36.84 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  36.28 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  41.38 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  36.07 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
292 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  28.81 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  27.18 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  40.16 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  28.35 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  35.71 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  37.29 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
271 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  28.86 
 
 
235 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  36.61 
 
 
261 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
270 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
297 aa  52  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  33.33 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>