184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0641 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  50.2 
 
 
246 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  32.22 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  25 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  24.66 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  26.67 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  27.38 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  26.57 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  25.1 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
311 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  25.78 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  25 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  25.98 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  27.57 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  25.52 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  25.52 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  25.52 
 
 
301 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  25.52 
 
 
301 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  25.52 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  25.59 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  25.59 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  25.52 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  25.17 
 
 
336 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  34.03 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  29.88 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  23.31 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  25.88 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  24.49 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  23.67 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  25.82 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  23.81 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  23.08 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  25.32 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  24.18 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  31.25 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  30.47 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  31.25 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.48 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  25.3 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.29 
 
 
301 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  27.2 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
274 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  24.7 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
279 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  32.59 
 
 
229 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  25.44 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  26.8 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  24.89 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  27.2 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  27.2 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  24.8 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  26.53 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  25.1 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  24.45 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  28.86 
 
 
225 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.85 
 
 
443 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  26.09 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  25 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  22.09 
 
 
270 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  25.1 
 
 
238 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  23.43 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  25.86 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  34.38 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  23.04 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  24.85 
 
 
265 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  22.08 
 
 
234 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  23.33 
 
 
257 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  26.75 
 
 
263 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 
241 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  28.29 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  27.39 
 
 
263 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>