180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3455 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  100 
 
 
234 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  52.3 
 
 
243 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  47.72 
 
 
244 aa  223  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  52.99 
 
 
241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  48.72 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  49.57 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  38.79 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.28 
 
 
235 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  39.43 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  39.09 
 
 
273 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  36.04 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  41.15 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  38.98 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  37.04 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  37.02 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  37.45 
 
 
225 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  36.71 
 
 
237 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  36.75 
 
 
237 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  37.7 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  43.8 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  36.73 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  45.13 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  30.42 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  34.84 
 
 
248 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  30.21 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  36.28 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  36.28 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  29.8 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  29.39 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
237 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  33.61 
 
 
222 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  47.46 
 
 
267 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
235 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  32.5 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  31.38 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  33.33 
 
 
195 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  34 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  31.71 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
278 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  30.45 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  32.22 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  31.76 
 
 
261 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.78 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.74 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  29.34 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  30.11 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  28.91 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  38.64 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  38.64 
 
 
309 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  38.64 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  38.64 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  36.36 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  28.52 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  28.52 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  31.85 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  26.89 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  29.39 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  30.04 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  28.16 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.49 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  27.69 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
311 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  26.61 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  29.36 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  36.96 
 
 
120 aa  62  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
294 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  36.36 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
294 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1935  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.985478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  34.55 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  27.69 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  27.24 
 
 
294 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  27.64 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  27.8 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  27.46 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  26.25 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  27.16 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  26.64 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  30.67 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  43.12 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  27.57 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  26.77 
 
 
278 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  30.67 
 
 
263 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  25.1 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  29.88 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>