234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2687 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  100 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  41.48 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  40 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  38.26 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.22 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  38.98 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  38.03 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  35.96 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  34.55 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  36.67 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  36.02 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  35.44 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  34.2 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  34.47 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  32.05 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  34.82 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  34.82 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  34.82 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  28.87 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  28.87 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  32.91 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  32.07 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  33.62 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  32.1 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  28.95 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  40.91 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  29.55 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  29.31 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  33.9 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  35.2 
 
 		 229 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  29.03 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  29.89 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  30.38 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  25.68 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  25.68 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  25.68 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  29.01 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.31 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  33.63 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  30.69 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  36.09 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  36.09 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  36.09 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  36.09 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  36.09 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  36.09 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  36.09 
 
 		 301 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  36.09 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  32.64 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  32.64 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  30.92 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  28.93 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  30.45 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  29.1 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  34.65 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  32.84 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  30.59 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  30.82 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.67 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  39.64 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  34.43 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  37.72 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  36.36 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  37.17 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  24.69 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  34.74 
 
 		 349 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  30.91 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  39.51 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  33.96 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>