38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31050  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00870089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5653  hypothetical protein  43.75 
 
 
235 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218337  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5884  hypothetical protein  43.33 
 
 
235 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4408  hypothetical protein  33.48 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2719  hypothetical protein  29.46 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  25.94 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  25.94 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  25.47 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  37.84 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  33.06 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  32.28 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  29.75 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  32.35 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  48.44 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  28.14 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  29.2 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.29 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  33.93 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  38.37 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  38.37 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  38.14 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  24.49 
 
 
267 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  33.06 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  27.84 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  34.29 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  31.5 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  30.33 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  30.97 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  30.23 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
208 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
278 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  30.65 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>