284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3533 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  100 
 
 
267 aa  555  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  44.26 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  44.21 
 
 
246 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.35 
 
 
235 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  39.17 
 
 
244 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  42.36 
 
 
243 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  39.75 
 
 
241 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  44.07 
 
 
239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  38.79 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  38.72 
 
 
273 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  38.91 
 
 
244 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  36.68 
 
 
231 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  36.68 
 
 
231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  36.68 
 
 
231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  38.5 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  35.81 
 
 
229 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  34.18 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  36.05 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  36.55 
 
 
248 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  35.98 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  33.47 
 
 
241 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  39.89 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  35.04 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  33.47 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
242 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  33.47 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  33.33 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  32.91 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  31.09 
 
 
237 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  48.65 
 
 
224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  32.12 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
248 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  32.27 
 
 
223 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  32.27 
 
 
223 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  31.22 
 
 
223 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
237 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  29.05 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  27.8 
 
 
222 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  33.33 
 
 
235 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.15 
 
 
238 aa  92.4  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  28.86 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  29.06 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  33.33 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  33.33 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  30.56 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  31.3 
 
 
336 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  31.3 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  31.3 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  31.3 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  31.3 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  31.3 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  29.86 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  27.73 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  24.62 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  32.12 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  36.04 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.51 
 
 
571 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  33.64 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  34.85 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  24.8 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.71 
 
 
234 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  25.82 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  24.9 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  26.53 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  30.08 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 
229 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  30.56 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 
285 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  36.79 
 
 
263 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  28.97 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  28.48 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  28.16 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>