173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1696 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  64.88 
 
 		 242 aa  334  9e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  66.67 
 
 		 247 aa  331  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  47.35 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0103  salicylate esterase  58.1 
 
 		 111 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  35.5 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.08 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  32.28 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  34.65 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  36.31 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  36.87 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  34.16 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  36.79 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  43.44 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3329  esterase  34.45 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  35.75 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  35.05 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  29.1 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  45.87 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.12 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  30.71 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  35.11 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  31.02 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  29.08 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  31.63 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  38.66 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  41.96 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7397  putative esterase  29.61 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  28.75 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  31.49 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  38.79 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  43.97 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  43.97 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  42.74 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  29.13 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  29.13 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1296  hypothetical protein  40.22 
 
 		 120 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0353924  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  29.13 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  30.15 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  31.77 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4079  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.313726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  42.24 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  44.64 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  30.42 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  27.38 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  31.58 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  26.29 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.57 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  28.69 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  26.07 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  38.39 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  26.83 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  28.22 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  29.11 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  28.87 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  27.82 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  28.22 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  26.59 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  27.71 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  33.91 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.19 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  27.78 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  27.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  30.6 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  30.6 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  30.6 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  30.6 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  30.6 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  27.76 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  27.69 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  39.64 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  37.27 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.36 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  56.25 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  27.53 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  31.41 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  27 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  27.2 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  25.33 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  29.85 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  27.71 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  29.85 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  25 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  26.12 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>